46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  41.36 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  39.63 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  41.71 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  37.79 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  35.02 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  34.12 
 
 		 227 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  22.83 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  27.43 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  22.17 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  22.89 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1362  hypothetical protein  29.26 
 
 		 475 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431827  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  43.96 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>