50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4852 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  51.8 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  45.58 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  45.81 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  41.78 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  39.09 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  39.09 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  39.09 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  26.83 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  30.96 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  27 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  29.68 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  27.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 225 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>