68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5848 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  62.68 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  51.2 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  53.81 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  53.81 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  53.81 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  44.61 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  41.71 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  41.06 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  36.54 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  35.27 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  35.02 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  29.72 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  29.6 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  25.4 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  25.4 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  25.4 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25.4 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  25.4 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  25.4 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  25.51 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  32.4 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  28.7 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2381  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43402  normal  0.916761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 192 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>