52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3634 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  46.61 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  47.56 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  49.53 
 
 		 214 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  36.53 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 225 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  34.53 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  35.75 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  34.91 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  35.27 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  38.42 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  25.5 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  25.73 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  25.73 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  25.73 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  27.37 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  26.82 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>