60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2939 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  90.22 
 
 		 233 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  57.78 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  37.12 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  39.07 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 224 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  34.1 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  37.44 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.35 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  24.4 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.35 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  24.35 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  23.92 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.35 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  23.83 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  23.83 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  27.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4785  response regulator receiver  43.48 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 241 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 115 aa  42  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 213 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>