13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2175 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 115 aa  224  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  59.13 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  35.44 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  30.1 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  30.86 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  32.5 
 
 		 238 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  22.68 
 
 		 133 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>