13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1436 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 116 aa  224  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  59.13 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1438  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  32.1 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 128 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0140  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129788  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  30.59 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>