16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1397 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  60.63 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  36.61 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  38.39 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  36.22 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  39.74 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1438  transcriptional regulator, TrmB  35.63 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 155 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  31.46 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>