32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2081 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 125 aa  255  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  69.92 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  46.67 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  36.22 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  36.45 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 172 aa  50.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  35.29 
 
 		 401 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  40.32 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  32.79 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  33.8 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  35.38 
 
 		 405 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  31.94 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  30.19 
 
 		 409 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  29.03 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.51 
 
 		 503 aa  40.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1715  ROK family protein  31.82 
 
 		 425 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.853629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>