14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1032 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  82.17 
 
 		 132 aa  217  5e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  46.67 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  48.72 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  38.39 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  35.83 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  41.84 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0137  hypothetical protein  42.03 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00282501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>