23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0146 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  26.15 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  23.21 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  32.38 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  28.42 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  40.98 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  25.62 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  24.74 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>