26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1935 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  42.58 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  32.89 
 
 		 205 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  37.07 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  34.58 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  26.44 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  20.95 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  21.15 
 
 		 130 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  24.35 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  18.42 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  30.97 
 
 		 354 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  30.97 
 
 		 342 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 339 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  18.42 
 
 		 130 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 327 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  29.13 
 
 		 108 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>