42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2638 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  52.73 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  52.73 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  52.73 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  37.44 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  37.9 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 212 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  27.35 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  22.52 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  22.07 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  29.6 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  21.8 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  30.57 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  20.09 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  20.09 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  20.09 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  20.09 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  19.63 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  19.63 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  19.63 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  19.63 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  19.63 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 218 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>