More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0808 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0808  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.08 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  29.36 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.88 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.09 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 250 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>