133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3070 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  72.02 
 
 		 219 aa  328  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  71.56 
 
 		 219 aa  327  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  63.35 
 
 		 227 aa  289  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  62.5 
 
 		 228 aa  285  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  61.09 
 
 		 234 aa  281  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  61.57 
 
 		 217 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  51.63 
 
 		 214 aa  236  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  34.11 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  29.72 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  30.62 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  30.62 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  30.62 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  33.65 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  31.53 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  30.62 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  32.51 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  30.48 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  28.97 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  29.58 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  29.72 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  28.17 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  33.01 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 280 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  27.14 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  28.24 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  28.08 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  29.38 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  29.38 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  27.09 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  30.1 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  26.13 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  23.67 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>