118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1711 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  47.06 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  45.77 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  50.24 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  43.84 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  43.84 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  44.28 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  47.8 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  43.07 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  44.28 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  43.28 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  47.32 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  42.36 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  41 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  45.32 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  43.63 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  44.12 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  44.12 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  43.63 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  30.73 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  31.07 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  31.55 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  30.73 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  30.62 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  28.36 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  29.65 
 
 		 274 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  27.49 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  30.52 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  29.81 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  32.37 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  23.9 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  26.84 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  29.06 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 268 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>