122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2510 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  56.94 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  54.09 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  54.09 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  55.35 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  49.33 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  53.05 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  55.92 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  52.11 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  49.1 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  51.64 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  48.85 
 
 		 280 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  50.68 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  48.17 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  48.34 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  49.76 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  46.92 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  44.23 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  49.03 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  48.53 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 271 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  40.09 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  46.38 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  43.56 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  37.44 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  39.15 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1670  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 270 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  27.8 
 
 		 210 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  27.8 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  26.34 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  26.32 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  25.37 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  25.49 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  26.09 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  25.24 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  27.64 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  27.64 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  24.29 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  30.52 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  25.52 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  27.78 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  31.68 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  27.18 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  25.85 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  22.01 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  26.01 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  26.01 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  26.01 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  26.01 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>