119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2084 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  73.61 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  53.28 
 
 		 273 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  54.27 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  51.69 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  53.04 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  50.83 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  53.39 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  49.05 
 
 		 237 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  49.52 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  49.15 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  48.07 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  53.81 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  53.47 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  47.39 
 
 		 238 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  45.97 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 		 238 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  50.23 
 
 		 220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  44.98 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  48.65 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  43.04 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  49.77 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  46.12 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  51.67 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  50.99 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  47.71 
 
 		 238 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  46.38 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  48.6 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  49.04 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  39.21 
 
 		 245 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1670  putative transcriptional regulator  46.7 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 		 210 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  30.1 
 
 		 210 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 210 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 210 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 210 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  29.27 
 
 		 210 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 217 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 219 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 210 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  27.94 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  28.43 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  27.05 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  26.83 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  25.24 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 		 203 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  25.82 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  29.27 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  29.27 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  25.99 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  25.27 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  24.77 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>