119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00716 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  92.61 
 
 		 206 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  74.02 
 
 		 205 aa  318  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  52.48 
 
 		 205 aa  228  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  51.98 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  51.23 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  50.5 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  50.5 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  49.01 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  47.26 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  46.04 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  46.8 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  40 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  41.97 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  39.2 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  39.2 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 214 aa  141  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  29.21 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  29.21 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  29.21 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 248 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  25.71 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 252 aa  95.9  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  30.06 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  28.42 
 
 		 275 aa  91.7  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 273 aa  81.3  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  24.51 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  23.9 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 271 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  22.61 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  29.41 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  26.9 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  26.9 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  24.88 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  22.12 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>