More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1936 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  81.44 
 
 		 111 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  72.16 
 
 		 97 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  76.19 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  71.76 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  70.59 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  67.02 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  76.71 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  49.33 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  53.62 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  52.17 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.33 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  48.1 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.33 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  53.73 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 112 aa  66.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.8 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.8 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  46.03 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  34.67 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  39.51 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  35.44 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.94 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.51 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.51 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 275 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.11 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.67 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  37.8 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  42.17 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.17 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.31 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.11 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  32 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>