More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2010 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  94.12 
 
 		 357 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 357 aa  729    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  80 
 
 		 356 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  79.15 
 
 		 356 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  79.26 
 
 		 362 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  75.77 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  75.77 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  75.49 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  74.5 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  75.07 
 
 		 356 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  74.79 
 
 		 356 aa  547  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  74.79 
 
 		 356 aa  547  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  74.79 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  74.5 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  75.07 
 
 		 356 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  75.07 
 
 		 356 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  73.5 
 
 		 359 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  73.5 
 
 		 359 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  74.5 
 
 		 356 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  73.5 
 
 		 359 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  73.22 
 
 		 359 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  73.5 
 
 		 359 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  73.07 
 
 		 353 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  61.52 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  60.34 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  60.92 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  59.77 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  58.33 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  54.21 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  49.85 
 
 		 359 aa  349  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 371 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 		 391 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 		 406 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  47.43 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  47.14 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  46.59 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  45.45 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  45.8 
 
 		 348 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  46.49 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  45.38 
 
 		 399 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  45.1 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  45.1 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  44.82 
 
 		 386 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  43.8 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  43.64 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  40.86 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  41.03 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  36.65 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  39.28 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  45.2 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  38.05 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  38.03 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.77 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  34.47 
 
 		 447 aa  205  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  34.01 
 
 		 410 aa  205  8e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  35.26 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  36.02 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.65 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.22 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 		 401 aa  172  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.48 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  31.84 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  33.13 
 
 		 382 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 		 376 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  31.34 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  31.05 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  30.52 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  31.51 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>