More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09680 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
402 aa  778    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  49.44 
 
 
364 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  46.94 
 
 
354 aa  295  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
365 aa  289  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
365 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
359 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
356 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
356 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
359 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
359 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
359 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
356 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
356 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
356 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  37.5 
 
 
356 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
356 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  36.88 
 
 
382 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
353 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  38.31 
 
 
357 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 
356 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
356 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
357 aa  216  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
371 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.27 
 
 
374 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
368 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
346 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
346 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  36.74 
 
 
356 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
346 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
360 aa  189  5e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
348 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  30.64 
 
 
349 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  36.16 
 
 
360 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
348 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.95 
 
 
373 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  33.01 
 
 
364 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  33.01 
 
 
364 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
391 aa  176  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  33.69 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 
362 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  35.64 
 
 
373 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
399 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 
349 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
399 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  34.45 
 
 
386 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
344 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.54 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
357 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  33.04 
 
 
410 aa  156  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.16 
 
 
358 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  32.58 
 
 
447 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 
371 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
366 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  29.3 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
370 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  33.44 
 
 
383 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
351 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  31.55 
 
 
382 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  36.48 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.25 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 
370 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  28.98 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  29.21 
 
 
365 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
350 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  28.93 
 
 
357 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  33 
 
 
369 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 
367 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 
350 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  34.08 
 
 
409 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 
371 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
370 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  32.91 
 
 
355 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  28.65 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 
357 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 
373 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
350 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  35.88 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>