More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003847 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
346 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  97.4 
 
 
346 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  88.44 
 
 
346 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  84.26 
 
 
346 aa  600  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  61.81 
 
 
356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  61.63 
 
 
356 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  62.21 
 
 
356 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  62.21 
 
 
356 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  62.21 
 
 
356 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  60.92 
 
 
357 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  60.7 
 
 
382 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  60.7 
 
 
382 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  60.23 
 
 
356 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  61.63 
 
 
356 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  61.92 
 
 
356 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  61.92 
 
 
356 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  61.63 
 
 
356 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  61.92 
 
 
356 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  60.41 
 
 
382 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  60.47 
 
 
359 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  60.47 
 
 
359 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  59.48 
 
 
357 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  60.47 
 
 
359 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  60.17 
 
 
359 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  60.17 
 
 
359 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  60.64 
 
 
362 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  57.35 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  57.35 
 
 
356 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
360 aa  364  1e-99  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 
371 aa  345  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
406 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
401 aa  328  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  53.61 
 
 
396 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
391 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  51.69 
 
 
399 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  53.63 
 
 
352 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
399 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  48.29 
 
 
373 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  46.93 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  51.08 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  48.26 
 
 
349 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  48.1 
 
 
348 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  47.77 
 
 
351 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  47.77 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  42.58 
 
 
368 aa  279  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
365 aa  258  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
365 aa  258  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  41.38 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  47.55 
 
 
362 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  41.95 
 
 
364 aa  249  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 
374 aa  215  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.9 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
351 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  37.65 
 
 
349 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 
355 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  34.45 
 
 
410 aa  193  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  36.29 
 
 
373 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  33.81 
 
 
447 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
402 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  37.77 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
358 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.96 
 
 
351 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
344 aa  169  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  36.16 
 
 
369 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 
355 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.51 
 
 
401 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 
373 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.15 
 
 
364 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.4 
 
 
358 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  33.02 
 
 
364 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
365 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
363 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
363 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
355 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  30.14 
 
 
383 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 
355 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  28.07 
 
 
369 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
386 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
358 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
357 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
371 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
362 aa  145  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 
356 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.45 
 
 
368 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
357 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  35.37 
 
 
372 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  31.84 
 
 
356 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
387 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 
349 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
350 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>