More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1135 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
346 aa  714    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  84.26 
 
 
346 aa  600  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  83.38 
 
 
346 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  81.92 
 
 
346 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  60.93 
 
 
356 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  59.65 
 
 
356 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 
382 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 
382 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  58.06 
 
 
382 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  58.33 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  59.83 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  58.96 
 
 
356 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 
356 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  58.96 
 
 
356 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 
356 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  58.96 
 
 
356 aa  411  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 
356 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  59.25 
 
 
356 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  58.6 
 
 
362 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  56.9 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
353 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  57.56 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  57.56 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  57.27 
 
 
359 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  57.56 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  57.27 
 
 
359 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  55.62 
 
 
356 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  53.69 
 
 
360 aa  352  7e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
401 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
406 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
391 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
396 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  48.43 
 
 
373 aa  328  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
386 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
399 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
399 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  49.42 
 
 
349 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
399 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  48 
 
 
371 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  48.96 
 
 
351 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  51.06 
 
 
352 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
359 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  47.48 
 
 
356 aa  309  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  46.65 
 
 
348 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
368 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  40.57 
 
 
365 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  40.57 
 
 
365 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  41.09 
 
 
354 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  41.57 
 
 
364 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  46.09 
 
 
362 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
351 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
357 aa  215  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 
374 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
349 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 
351 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.57 
 
 
348 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.53 
 
 
373 aa  189  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 
344 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  32.73 
 
 
410 aa  179  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.57 
 
 
358 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
402 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  35.41 
 
 
447 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.81 
 
 
401 aa  159  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
369 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  34.27 
 
 
364 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.87 
 
 
364 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 
351 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.63 
 
 
364 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
363 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 
358 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  30.34 
 
 
383 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.41 
 
 
368 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.4 
 
 
373 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 
355 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  29.69 
 
 
349 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
370 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  30.46 
 
 
362 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.25 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  34.55 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
358 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
358 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
356 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 
353 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  28.97 
 
 
370 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  29.23 
 
 
386 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.9 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  27.73 
 
 
366 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>