More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1964 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
373 aa  759    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  74.4 
 
 
387 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  69.15 
 
 
383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  62.67 
 
 
371 aa  454  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  60.27 
 
 
386 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  56.52 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  37.08 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  40.33 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
364 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  38.95 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  40.28 
 
 
386 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
373 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
373 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  40.88 
 
 
369 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
385 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 
383 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  39.33 
 
 
365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  39.33 
 
 
365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  34 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  35.77 
 
 
370 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  40.28 
 
 
370 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  39.09 
 
 
374 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  35.24 
 
 
369 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
374 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  37.93 
 
 
374 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
358 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
365 aa  222  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 
370 aa  222  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
370 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  38.12 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
370 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  34.73 
 
 
374 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 
370 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
369 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 
388 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
376 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 
381 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
362 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
371 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  38.42 
 
 
363 aa  215  9e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.28 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 
371 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  36.61 
 
 
374 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
386 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  33.87 
 
 
371 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
369 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  33.87 
 
 
371 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
370 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
362 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
373 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
380 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  36.63 
 
 
369 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
380 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.53 
 
 
379 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  36.89 
 
 
366 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 
374 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
370 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  36.63 
 
 
369 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  37.26 
 
 
362 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
374 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
389 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
365 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 
370 aa  205  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
377 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  35.95 
 
 
378 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
363 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 
394 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
374 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6316  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
364 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  34.22 
 
 
366 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
364 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
365 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  34.21 
 
 
373 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0154  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
381 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.324772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  36.04 
 
 
371 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
399 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
371 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
365 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 
357 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
368 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 
366 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
364 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000204735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
360 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>