More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3872 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
370 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  89.73 
 
 
371 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  59.66 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  54.13 
 
 
369 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  45.33 
 
 
370 aa  319  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  44.44 
 
 
358 aa  315  6e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  47.45 
 
 
358 aa  315  6e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  46.96 
 
 
409 aa  302  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  42.28 
 
 
358 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  42.22 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  38.32 
 
 
351 aa  242  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
371 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
386 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
351 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  37.23 
 
 
357 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
355 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  39.29 
 
 
383 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 
362 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 
358 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 
366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  37.61 
 
 
350 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
366 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 
371 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
363 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  35.09 
 
 
383 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.48 
 
 
348 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
358 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  37.53 
 
 
387 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  39.53 
 
 
373 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.23 
 
 
360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  31.73 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  31.47 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  38.77 
 
 
365 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 
357 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 
368 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.07 
 
 
386 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  34.32 
 
 
365 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
371 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
388 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 
371 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 
365 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  40.05 
 
 
358 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
392 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
362 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.59 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 
373 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 
360 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 
363 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
365 aa  189  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
365 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 
349 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  37.3 
 
 
357 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 
350 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
350 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 
355 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  30.13 
 
 
371 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  34.51 
 
 
370 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
370 aa  186  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
365 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
373 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 
363 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.05 
 
 
350 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  39.73 
 
 
368 aa  186  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
357 aa  186  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  35.54 
 
 
350 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  37.74 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  38.02 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 
352 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
370 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
356 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
370 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  36.27 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
359 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6316  histidinol-phosphate aminotransferase  33.96 
 
 
370 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 
351 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
357 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
365 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 
353 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.6 
 
 
363 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  35.58 
 
 
364 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
371 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  37.63 
 
 
366 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  36.55 
 
 
353 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  38.69 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>