More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2116 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
388 aa  790    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  55.8 
 
 
362 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 
374 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  45.36 
 
 
386 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  46.09 
 
 
370 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  45.2 
 
 
370 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  46.13 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  43.73 
 
 
392 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  44.32 
 
 
372 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 
369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  45.11 
 
 
374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  43.09 
 
 
369 aa  305  9.000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
373 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  43.54 
 
 
369 aa  298  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  45.81 
 
 
374 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  43.3 
 
 
369 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  45.13 
 
 
369 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  45.03 
 
 
364 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  40.63 
 
 
380 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  45.63 
 
 
374 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  45.69 
 
 
383 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  42.54 
 
 
370 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  40.75 
 
 
380 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  45.56 
 
 
373 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  44.48 
 
 
370 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  41.29 
 
 
367 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  44.48 
 
 
371 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  43.92 
 
 
370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  45.48 
 
 
365 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  45.48 
 
 
365 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  43.85 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  43.73 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  43.7 
 
 
379 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  42.94 
 
 
371 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  44.2 
 
 
374 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  43.01 
 
 
376 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
373 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  41.56 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  41.53 
 
 
394 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
377 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  40.73 
 
 
358 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  44.67 
 
 
365 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  38.59 
 
 
374 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  38.93 
 
 
386 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 
370 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 
384 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
370 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  40.5 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  41.78 
 
 
363 aa  259  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  42.19 
 
 
374 aa  259  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
370 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  40.33 
 
 
381 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
366 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  39.55 
 
 
365 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 
371 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  38.18 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
389 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
370 aa  235  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  39.22 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  41.19 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  36.32 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 
373 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
373 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  38.59 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
370 aa  226  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
355 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
369 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  35.79 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  37.26 
 
 
373 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  33.9 
 
 
366 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
371 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3575  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
374 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.522328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
371 aa  215  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 
366 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  41.46 
 
 
360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6316  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 
366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
371 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  39.05 
 
 
375 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  34.79 
 
 
387 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  36.66 
 
 
372 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 
352 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  35.85 
 
 
372 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
365 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 
366 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>