More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4254 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 365 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  86.3 
 
 		 365 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  89.86 
 
 		 365 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  88.77 
 
 		 365 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  82.04 
 
 		 365 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  80.77 
 
 		 365 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  78.85 
 
 		 365 aa  597  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  66.02 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  60.16 
 
 		 366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  62.5 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  64.44 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  61.05 
 
 		 369 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  59.94 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  58.22 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  59.73 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  56.08 
 
 		 371 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  59.83 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  59.83 
 
 		 368 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  58.84 
 
 		 368 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  57.14 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  57.78 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  57.78 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  57.78 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  59.04 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  52.94 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  48.33 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  48.62 
 
 		 375 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  47.9 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  46.56 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  47.62 
 
 		 361 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  47.62 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  47.09 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  47.77 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  44.57 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  44.81 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.26 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 		 374 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 369 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  37.16 
 
 		 386 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.77 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  39 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  39 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  35.79 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  39.11 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  38.17 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 		 365 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  37.77 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  38.81 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  39.17 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.34 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 374 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.25 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  36.9 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36.03 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.13 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.1 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.03 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  31.62 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>