More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1312 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
374 aa  754    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  92.51 
 
 
374 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  66.84 
 
 
374 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  67.86 
 
 
374 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  65.05 
 
 
370 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  65.32 
 
 
370 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  67.21 
 
 
374 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  65.23 
 
 
371 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  65.67 
 
 
376 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  64.85 
 
 
374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  57.42 
 
 
365 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  54.97 
 
 
370 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 
370 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 
392 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  53.17 
 
 
369 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  52.3 
 
 
374 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  54.67 
 
 
384 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  49.73 
 
 
369 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  51.92 
 
 
370 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  52.88 
 
 
369 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  52.85 
 
 
370 aa  358  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  53.17 
 
 
369 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 
373 aa  355  8.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  52.05 
 
 
369 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  51.51 
 
 
362 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  46.83 
 
 
367 aa  320  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  48.24 
 
 
385 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  46.26 
 
 
371 aa  316  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  46.83 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  47.97 
 
 
379 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  47.58 
 
 
373 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  47.12 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  46.3 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  46.61 
 
 
381 aa  295  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 
365 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 
365 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  46.32 
 
 
394 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
386 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  40.65 
 
 
372 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  42.27 
 
 
358 aa  279  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  43.41 
 
 
363 aa  279  6e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
365 aa  272  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 
388 aa  265  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  40.93 
 
 
370 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.32 
 
 
364 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  41.13 
 
 
362 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  42.9 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
370 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
370 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
370 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  38.16 
 
 
370 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  40.45 
 
 
383 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  39.73 
 
 
369 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  39.47 
 
 
369 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  39.01 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.1 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
365 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  37.6 
 
 
383 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  36.74 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  41.07 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  35.25 
 
 
368 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  34.34 
 
 
366 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
365 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
370 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
369 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
373 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
370 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  41.89 
 
 
362 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 
366 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.13 
 
 
365 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
387 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
364 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  38.13 
 
 
365 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
378 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
369 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
365 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  39.82 
 
 
392 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
365 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 
377 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 
365 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  38.6 
 
 
372 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
371 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 
368 aa  222  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  38.6 
 
 
372 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  38.5 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  38.5 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  37.87 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  35.81 
 
 
371 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
365 aa  219  5e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 
364 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
389 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>