More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0959 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  96.12 
 
 
361 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  99.72 
 
 
361 aa  739    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
361 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  73.95 
 
 
367 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  71.19 
 
 
362 aa  522  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  70.93 
 
 
361 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  59.14 
 
 
360 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  51.24 
 
 
378 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  51.37 
 
 
368 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  48.47 
 
 
366 aa  349  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  50.99 
 
 
392 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  48.22 
 
 
368 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  48.22 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  49.16 
 
 
372 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 
364 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 
369 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  47.62 
 
 
371 aa  332  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  48.33 
 
 
362 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
372 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  49.16 
 
 
372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  46.94 
 
 
368 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  47.61 
 
 
368 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  48.03 
 
 
365 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  48.47 
 
 
364 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  48.45 
 
 
369 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  47.62 
 
 
365 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  48.03 
 
 
365 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
370 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
365 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  46.78 
 
 
365 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  46.5 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  45.71 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
370 aa  299  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  48.24 
 
 
368 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  46.85 
 
 
371 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  48.59 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  46.61 
 
 
371 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  44.72 
 
 
368 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  43.66 
 
 
375 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
381 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
369 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  38.02 
 
 
369 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 
380 aa  224  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 
380 aa  222  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  37.42 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  39.34 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  38.27 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  38.27 
 
 
369 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  35.8 
 
 
373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  39.12 
 
 
374 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  39.12 
 
 
374 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
392 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 
363 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  38.92 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  37.83 
 
 
386 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
385 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 
370 aa  209  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 
365 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  41.08 
 
 
370 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
373 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
370 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
377 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
370 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
370 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
373 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
369 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.29 
 
 
376 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
379 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
365 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
365 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  38.05 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.08 
 
 
374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
384 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
358 aa  195  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  34.86 
 
 
368 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  38.17 
 
 
362 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
365 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
394 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
371 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
375 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
374 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 
364 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
366 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
352 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  38.1 
 
 
373 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
386 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>