More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5817 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
370 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  89.73 
 
 
370 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  73 
 
 
372 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  70.68 
 
 
392 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  74.24 
 
 
372 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  73.55 
 
 
372 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  65.93 
 
 
366 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  66.58 
 
 
378 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  75.99 
 
 
371 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  64.44 
 
 
365 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  66.85 
 
 
368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  62.43 
 
 
365 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  64.07 
 
 
369 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  63.99 
 
 
371 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  62.98 
 
 
369 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  62.78 
 
 
365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  62.5 
 
 
365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  61.05 
 
 
365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  61.98 
 
 
365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  63.01 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  63.01 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  60.56 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  62.22 
 
 
368 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  63.23 
 
 
364 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  61.28 
 
 
373 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  58.26 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  52.33 
 
 
368 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  49.04 
 
 
361 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  48.49 
 
 
361 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
375 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
361 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  53.71 
 
 
361 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  48.6 
 
 
362 aa  322  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  46.58 
 
 
367 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  49.03 
 
 
368 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  51.37 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  49.46 
 
 
372 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
371 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  48.7 
 
 
368 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  44.72 
 
 
360 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  40.21 
 
 
369 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
373 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  40.9 
 
 
369 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 
371 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  42.06 
 
 
370 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  41.22 
 
 
373 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  37.94 
 
 
374 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  38.95 
 
 
369 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  38.42 
 
 
370 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
365 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
392 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
385 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  35.68 
 
 
370 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  41.01 
 
 
363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  43.68 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.78 
 
 
369 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 
362 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 
358 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  37.91 
 
 
386 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  42.19 
 
 
379 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  40.3 
 
 
374 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
370 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  40.91 
 
 
374 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 
365 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 
365 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 
384 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
371 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
370 aa  225  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  38.92 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  39.82 
 
 
370 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
383 aa  222  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.95 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  39.56 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
365 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 
373 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  40.37 
 
 
376 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35 
 
 
374 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
386 aa  215  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  38.92 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  38.79 
 
 
380 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
381 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
366 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  38.78 
 
 
377 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
366 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
365 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 
374 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>