More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0439 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
364 aa  731    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  57.85 
 
 
368 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
378 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 
366 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  49.31 
 
 
373 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  51.82 
 
 
392 aa  338  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  48.47 
 
 
361 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 
371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  48.47 
 
 
361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  49.03 
 
 
365 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  48.47 
 
 
361 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  47.77 
 
 
365 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  48.04 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
365 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  48.31 
 
 
362 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  48.3 
 
 
367 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 
372 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  46.65 
 
 
365 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  50.98 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  50.98 
 
 
372 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  48.71 
 
 
361 aa  308  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  46.37 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  48.18 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  47.06 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  47.9 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  48.18 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 
371 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  46.78 
 
 
368 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  46.78 
 
 
365 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  46.22 
 
 
368 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  50.98 
 
 
370 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  46.61 
 
 
362 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
360 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  44.79 
 
 
368 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  45.38 
 
 
371 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 
368 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  44.79 
 
 
372 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
375 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  38.12 
 
 
386 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  41.44 
 
 
381 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
362 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.59 
 
 
373 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
369 aa  227  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  37.23 
 
 
371 aa  225  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
374 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.7 
 
 
392 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
374 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
370 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
369 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  39.14 
 
 
365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
370 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 
374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
362 aa  215  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
383 aa  215  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  40.36 
 
 
363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  38.77 
 
 
386 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 
386 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
365 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
367 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
370 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
374 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  39.55 
 
 
364 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  35.77 
 
 
371 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
380 aa  209  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 
373 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
379 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
366 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 
370 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
376 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
384 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
370 aa  205  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.28 
 
 
372 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
370 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 
355 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
362 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  36.77 
 
 
373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  32.44 
 
 
389 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
362 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  30.39 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
371 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
388 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  39.34 
 
 
370 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
370 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
370 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.53 
 
 
370 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
370 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
370 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
373 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
374 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>