More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1183 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
365 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  83.7 
 
 
365 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  82.74 
 
 
365 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  82.32 
 
 
365 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  82.04 
 
 
365 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  82.09 
 
 
365 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  81.22 
 
 
365 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  65.37 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  62.98 
 
 
373 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  60.5 
 
 
366 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  59.89 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  58.24 
 
 
371 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  60.88 
 
 
364 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  60.55 
 
 
369 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  60.11 
 
 
365 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  59.12 
 
 
368 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  60.33 
 
 
369 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  60.11 
 
 
368 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  60.83 
 
 
370 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  58.95 
 
 
372 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  59.23 
 
 
372 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  58.73 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  56.99 
 
 
368 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  60.56 
 
 
370 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 
371 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  54.62 
 
 
362 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  48.75 
 
 
368 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
375 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  50.84 
 
 
361 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  48.2 
 
 
362 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  47.47 
 
 
361 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 
361 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  45.56 
 
 
367 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  44.88 
 
 
368 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  48.34 
 
 
371 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  46.37 
 
 
364 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  47.16 
 
 
368 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  45.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  42.15 
 
 
360 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  38.29 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
369 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 
374 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
369 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
370 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
369 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  37.77 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.61 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
362 aa  232  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
373 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  36.99 
 
 
386 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
365 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  36.9 
 
 
370 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
365 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 
385 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
363 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.5 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  37.96 
 
 
370 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 
373 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 
381 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 
370 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
392 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  33.9 
 
 
373 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 
358 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  38.31 
 
 
371 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
386 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
370 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 
374 aa  216  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.68 
 
 
374 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  39.01 
 
 
374 aa  215  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
374 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 
376 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  212  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  37.96 
 
 
374 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  36.65 
 
 
383 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
377 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  33.7 
 
 
374 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.86 
 
 
372 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
365 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
380 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
365 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  36.97 
 
 
362 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
380 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
374 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
365 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
366 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 
365 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.16 
 
 
363 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  36.78 
 
 
394 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
370 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
370 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>