More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0846 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  90.68 
 
 		 374 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  96.26 
 
 		 374 aa  708    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 374 aa  745    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  79.06 
 
 		 376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  77.2 
 
 		 371 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  74.73 
 
 		 370 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  74.73 
 
 		 370 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  76.86 
 
 		 374 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  67.91 
 
 		 374 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  66.94 
 
 		 374 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  63.81 
 
 		 365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  55.11 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  58.4 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  59.05 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  57.94 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  59.94 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  56.35 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  55.71 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  54.72 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  56.67 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  55.4 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  55.56 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  51.8 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  50.82 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  49.73 
 
 		 371 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  50.27 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  46.94 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  48.9 
 
 		 386 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  47.37 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  50.39 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  46.74 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  47.27 
 
 		 380 aa  312  6.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  47.27 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  45.11 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  44.29 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  43.33 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  48.49 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  46.07 
 
 		 363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  42.25 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  42.27 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  41.69 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  39.46 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  39.07 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  45.13 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 		 370 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  41.8 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  42.35 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  40.83 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  41.53 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  40.35 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  39.55 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.12 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  38.59 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  34.42 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  40.69 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  38.17 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  39.28 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  38.72 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  39.52 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  42.46 
 
 		 352 aa  226  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  36.03 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>