More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0695 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
372 aa  755    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  62.6 
 
 
368 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  63.59 
 
 
371 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  50.68 
 
 
372 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  48.9 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  50.96 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  50.96 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  47.08 
 
 
378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  47.62 
 
 
368 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
361 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  48.42 
 
 
365 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
365 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  49.44 
 
 
361 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  46.01 
 
 
365 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  46.83 
 
 
365 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  49.15 
 
 
361 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  45.75 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  49.73 
 
 
370 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  46.93 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  47.9 
 
 
362 aa  282  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  45.63 
 
 
365 aa  278  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  46.29 
 
 
369 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 
373 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
367 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  46 
 
 
369 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  49.46 
 
 
370 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  44.81 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  44.78 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  47.73 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  47.73 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 
371 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  47.13 
 
 
368 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  44.79 
 
 
364 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  46.97 
 
 
360 aa  265  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  48.26 
 
 
361 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  48.18 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  44.17 
 
 
364 aa  262  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 
392 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  45.3 
 
 
375 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  41.69 
 
 
368 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  40.35 
 
 
374 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
370 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  39.77 
 
 
374 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
369 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  39.06 
 
 
365 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  40.35 
 
 
374 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  38.99 
 
 
367 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  37.6 
 
 
370 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  36.97 
 
 
370 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
369 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  36.95 
 
 
380 aa  216  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.31 
 
 
376 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.36 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  37.01 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
380 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
384 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  39.84 
 
 
394 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 
371 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  35.44 
 
 
386 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
373 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
374 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
370 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  34.97 
 
 
362 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
374 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.72 
 
 
373 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 
373 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.01 
 
 
364 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 
374 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 
362 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 
374 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
368 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 
381 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.23 
 
 
379 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 
370 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  39.22 
 
 
377 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
370 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
363 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
383 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  34.64 
 
 
374 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
370 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.04 
 
 
372 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
370 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
370 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
370 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
370 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
370 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.84 
 
 
373 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>