More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0496 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  92.51 
 
 
374 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
374 aa  755    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  66.94 
 
 
374 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  65.32 
 
 
370 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  65.59 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  65.23 
 
 
371 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  67.03 
 
 
374 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  66.67 
 
 
374 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  64.58 
 
 
376 aa  474  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  64.58 
 
 
374 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  57.14 
 
 
365 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  53.83 
 
 
370 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 
392 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  52.3 
 
 
374 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  53.44 
 
 
370 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  52.89 
 
 
369 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  48.9 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  52.89 
 
 
369 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  51.66 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  52.32 
 
 
373 aa  352  7e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
384 aa  351  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  52.62 
 
 
369 aa  349  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  52.45 
 
 
370 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  51.79 
 
 
369 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  47.66 
 
 
362 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  46.28 
 
 
371 aa  316  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  48.78 
 
 
385 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  48.51 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  45.86 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  47.31 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  46.3 
 
 
380 aa  299  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  46.88 
 
 
381 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  44.96 
 
 
380 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  46.58 
 
 
394 aa  288  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  41.46 
 
 
372 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 
365 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 
365 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  43.68 
 
 
386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  42.54 
 
 
358 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  46.59 
 
 
365 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
363 aa  272  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  40.93 
 
 
370 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  42.47 
 
 
388 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.6 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
370 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.17 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
370 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  252  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  43.17 
 
 
373 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  38.29 
 
 
370 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.65 
 
 
362 aa  245  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.94 
 
 
374 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
383 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
369 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
369 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  39.67 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
365 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 
365 aa  232  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 
370 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  41.19 
 
 
373 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
366 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 
370 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
368 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  39.33 
 
 
363 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
364 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 
369 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  39.56 
 
 
368 aa  225  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  38.52 
 
 
366 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
365 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
387 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 
365 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 
373 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  41.32 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 
377 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1298  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
366 aa  218  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  37.26 
 
 
365 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  37.96 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
378 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
355 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  33.78 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
364 aa  212  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000204735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
360 aa  212  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>