More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9607 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 368 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.23 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  38.16 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  39.95 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  37.37 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  39.67 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  39.53 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  39.07 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  40.11 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  40.8 
 
 		 370 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  35.66 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.79 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.23 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  39.12 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.86 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  38.18 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  32.98 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  34.86 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  35.37 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  35.54 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  34.04 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  37.32 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  34.74 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  36.53 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  32.86 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  34.19 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>