More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2550 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 368 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  73.91 
 
 		 369 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  73.91 
 
 		 369 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  72.45 
 
 		 364 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  68.41 
 
 		 366 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  70.67 
 
 		 365 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  70.67 
 
 		 368 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  68.98 
 
 		 368 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  62.18 
 
 		 378 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  66.3 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  62.57 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  66.85 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  57.14 
 
 		 365 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  60.66 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  56.99 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  61.56 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  58.89 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  56.04 
 
 		 365 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  60.39 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  54.95 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  53.7 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  61.19 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 		 365 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  55.74 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  53.46 
 
 		 371 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  48.09 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  48.73 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  48.17 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  47.89 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  47.61 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  47.91 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  46.54 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  47.06 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  46.05 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  46.93 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 		 370 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  39.56 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  39.72 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.65 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  38.36 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 		 369 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  35.39 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  232  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.23 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  39.15 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  40.76 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  38.78 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  38.03 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  38.02 
 
 		 365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  37.97 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 370 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  40.44 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  40.45 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 376 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.16 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>