More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1116 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
370 aa  753    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  57.89 
 
 
369 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  59.13 
 
 
374 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  58.7 
 
 
369 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  56.08 
 
 
370 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  58.31 
 
 
370 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  55.59 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  57.07 
 
 
369 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  56.95 
 
 
370 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
373 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  56.63 
 
 
374 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  56.52 
 
 
369 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 
370 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  52.63 
 
 
369 aa  391  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 
370 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  57.43 
 
 
374 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 
365 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  57.06 
 
 
374 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  49.59 
 
 
392 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 
376 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  53.95 
 
 
373 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 
374 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  51.23 
 
 
371 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  54.97 
 
 
374 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  53.83 
 
 
374 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  50.94 
 
 
379 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  49.32 
 
 
385 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  52.11 
 
 
362 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  49.73 
 
 
380 aa  349  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  51.63 
 
 
384 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
380 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
367 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  48.24 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  49.59 
 
 
394 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  48.49 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  48.49 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  45.2 
 
 
388 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  43.87 
 
 
386 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  42.98 
 
 
372 aa  295  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  43.22 
 
 
362 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  40.67 
 
 
370 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  41.78 
 
 
362 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  41.36 
 
 
358 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 
369 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  43.92 
 
 
363 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  40.66 
 
 
369 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
370 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
370 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
370 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  41.76 
 
 
365 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
370 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
370 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
370 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
370 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
364 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  41.85 
 
 
373 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.26 
 
 
374 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
383 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
365 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  37.97 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
370 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
373 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  39.02 
 
 
370 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  34.19 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
364 aa  233  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 
366 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
362 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
366 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  38.36 
 
 
365 aa  228  9e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  33.9 
 
 
366 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
368 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
366 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
366 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
366 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
366 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 
369 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
375 aa  223  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  38.18 
 
 
360 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
369 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  40.84 
 
 
362 aa  222  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 
366 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
371 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
366 aa  219  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  37.95 
 
 
370 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
372 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  36.56 
 
 
373 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
389 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
378 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
377 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
372 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>