More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0717 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 374 aa  751    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  83.79 
 
 		 376 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  77.41 
 
 		 374 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  76.86 
 
 		 371 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  76.03 
 
 		 370 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  76.39 
 
 		 374 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  76.69 
 
 		 374 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  74.93 
 
 		 370 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  64.58 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  64.85 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  63.91 
 
 		 365 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  53.93 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 		 370 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  56.87 
 
 		 369 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  52.51 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  56.11 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  57.26 
 
 		 369 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  57.1 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  53.91 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  56.27 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  56.15 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  55.87 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  51.39 
 
 		 373 aa  362  9e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  53.91 
 
 		 370 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 		 371 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  46.17 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  49.32 
 
 		 385 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  47.51 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  49.73 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 		 379 aa  311  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  49.72 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  48.6 
 
 		 365 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  48.6 
 
 		 365 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  45.78 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  45.23 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  43.89 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  43.45 
 
 		 370 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.2 
 
 		 388 aa  295  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  49.29 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  46.59 
 
 		 381 aa  291  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  44.02 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  44.75 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  45.28 
 
 		 373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  43.34 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  40.57 
 
 		 370 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  45.04 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  38.98 
 
 		 374 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  37.37 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  42.02 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  39.61 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  42.62 
 
 		 365 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  45.4 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  43.84 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  37.87 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 		 364 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  41.53 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  36.74 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  39.45 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  41.46 
 
 		 355 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  42.12 
 
 		 352 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 		 373 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  36.8 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  40.27 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  36.03 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 		 372 aa  225  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  39.04 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  34.55 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 364 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 359 aa  222  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>