More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3018 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  100 
 
 
359 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  79.89 
 
 
359 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  69.23 
 
 
352 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  69.64 
 
 
360 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  71.72 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  60.8 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  60.62 
 
 
391 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  58.47 
 
 
355 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  53.54 
 
 
370 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  58.21 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  55.68 
 
 
376 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  55.65 
 
 
370 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 
355 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  53.87 
 
 
353 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  53.22 
 
 
363 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  51.13 
 
 
358 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  51.13 
 
 
358 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  50.85 
 
 
358 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  51.35 
 
 
367 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  51.4 
 
 
360 aa  328  9e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  54.44 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  53.54 
 
 
356 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  49.86 
 
 
351 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  51.71 
 
 
360 aa  322  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  57.19 
 
 
359 aa  322  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  48.17 
 
 
372 aa  319  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 
362 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  49.44 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  46.57 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  51.85 
 
 
372 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  53.58 
 
 
367 aa  308  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  52.72 
 
 
367 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  48.88 
 
 
366 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  47.83 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  53.65 
 
 
356 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  42.49 
 
 
363 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  44.19 
 
 
365 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  38.98 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
373 aa  238  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 
370 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
370 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  46.75 
 
 
333 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.21 
 
 
358 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  42.73 
 
 
362 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
366 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  41.76 
 
 
371 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 
374 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  41.06 
 
 
374 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  41.06 
 
 
374 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  42.74 
 
 
374 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  41.14 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 
370 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 
369 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
366 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
366 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.49 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  40.39 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  41.57 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
366 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
370 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
366 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
362 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  41.11 
 
 
374 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 
370 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  40.69 
 
 
369 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  42.34 
 
 
394 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
366 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
370 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  38.81 
 
 
369 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
362 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  34.53 
 
 
374 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 
362 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
383 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 
373 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
364 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  41.29 
 
 
384 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  39.27 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
352 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
352 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
374 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  39.88 
 
 
363 aa  199  9e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
370 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 
351 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 
370 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 
370 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>