More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2015 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
373 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  68.32 
 
 
375 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  57.45 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  57.92 
 
 
389 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  62.12 
 
 
375 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
386 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
370 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
383 aa  239  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 
363 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
371 aa  232  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 
370 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  39 
 
 
388 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
369 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
370 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
362 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 
374 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
373 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
369 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
369 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 
374 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
369 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
369 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  38.06 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
370 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
365 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
365 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  36.15 
 
 
380 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
380 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
373 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
374 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.96 
 
 
372 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
365 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
362 aa  209  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
394 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
370 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
366 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
370 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  32.59 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
370 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  31.52 
 
 
374 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
383 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
381 aa  199  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
366 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  35.79 
 
 
384 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
366 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
366 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
366 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
366 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
366 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  33.78 
 
 
366 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  32.8 
 
 
374 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 
371 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
366 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 
367 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
365 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
379 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  30.39 
 
 
365 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  31.73 
 
 
369 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  31.73 
 
 
369 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 
374 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.97 
 
 
373 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  30.17 
 
 
365 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
352 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
362 aa  186  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
367 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
371 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  29.56 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
362 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
351 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
373 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>