More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0387 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
351 aa  724    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  76.92 
 
 
352 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  76.92 
 
 
352 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  45.89 
 
 
366 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  46.18 
 
 
366 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  45.89 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  45.61 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  44.35 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  45.61 
 
 
366 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  45.61 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  45.61 
 
 
366 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  45.68 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  43.42 
 
 
370 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  45.33 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  45.33 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  43.7 
 
 
370 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
370 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
370 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
370 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  45.1 
 
 
365 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  43.42 
 
 
370 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
370 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  43.7 
 
 
365 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.59 
 
 
383 aa  265  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
357 aa  249  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 
358 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  38.64 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  38.51 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  37.93 
 
 
386 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  38.68 
 
 
365 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  38.68 
 
 
365 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  38.97 
 
 
369 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 
362 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
369 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
370 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
373 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 
369 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
373 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  35.77 
 
 
372 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 
374 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  36.93 
 
 
352 aa  222  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 
373 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
370 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 
367 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
370 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.56 
 
 
374 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  35.53 
 
 
369 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  36.94 
 
 
391 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  35.8 
 
 
369 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 
362 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
371 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  35.77 
 
 
356 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
370 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
380 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
365 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
380 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
374 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  35.77 
 
 
365 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  35.83 
 
 
351 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.88 
 
 
374 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  35.67 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 
367 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
392 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  34.37 
 
 
370 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  35.83 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  35.83 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  35.13 
 
 
369 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
365 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 
370 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  35.88 
 
 
362 aa  199  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  36.77 
 
 
351 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  35.56 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 
359 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
365 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 
365 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
364 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
385 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
362 aa  192  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 
370 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  36.97 
 
 
394 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  34.76 
 
 
384 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
381 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
371 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3654  aminotransferase class I and II  38.75 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  43.78 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
371 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>