More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0952 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
384 aa  763    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  59.47 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  63.64 
 
 
365 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  62.01 
 
 
369 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  61.69 
 
 
362 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  62.87 
 
 
369 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  60.22 
 
 
374 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  60.17 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  60.5 
 
 
374 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  60.98 
 
 
370 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  58.38 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  61.26 
 
 
369 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  58.73 
 
 
376 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  60.71 
 
 
369 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  57.72 
 
 
371 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  56.7 
 
 
374 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  58.01 
 
 
370 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  57.34 
 
 
370 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  57.1 
 
 
374 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  51.77 
 
 
370 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  54.62 
 
 
374 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  53.55 
 
 
370 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  48.52 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  54.79 
 
 
371 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  52.07 
 
 
385 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  53.95 
 
 
379 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  50.93 
 
 
373 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  46.2 
 
 
369 aa  334  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  51.5 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  51.5 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  46.37 
 
 
367 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
381 aa  305  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  47.96 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  49.36 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  47.93 
 
 
380 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  46.07 
 
 
363 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  42.16 
 
 
370 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  42.82 
 
 
358 aa  292  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  47.97 
 
 
365 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  50.28 
 
 
373 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  45.6 
 
 
364 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 
388 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  43.4 
 
 
374 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  42.33 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  43.82 
 
 
365 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
370 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 
370 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 
370 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  42.82 
 
 
363 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
370 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 
370 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
370 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
370 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  43.97 
 
 
362 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
370 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
365 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  41.99 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  41.55 
 
 
369 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  42.31 
 
 
383 aa  249  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 
369 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
372 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  40.4 
 
 
370 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  40.4 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  43.42 
 
 
377 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
364 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  41.53 
 
 
387 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  39.63 
 
 
372 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 
365 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  35.05 
 
 
366 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  38.99 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  39.17 
 
 
371 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  35.54 
 
 
365 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
366 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.51 
 
 
366 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 
366 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 
366 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 
373 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
366 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
365 aa  229  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
392 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  40.37 
 
 
370 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  36.91 
 
 
365 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  39.82 
 
 
373 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  36.89 
 
 
365 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
362 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
367 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>