More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1194 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
373 aa  768    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  53.95 
 
 
370 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  53.24 
 
 
374 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  53.48 
 
 
369 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  52.7 
 
 
369 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  52.92 
 
 
369 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  53.26 
 
 
370 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  53.2 
 
 
370 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  51.98 
 
 
369 aa  362  6e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  51.79 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  52.21 
 
 
370 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  50.69 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  51.25 
 
 
369 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  51.97 
 
 
374 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  51.8 
 
 
374 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  50.56 
 
 
365 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  51.84 
 
 
374 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  49.04 
 
 
371 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  52.32 
 
 
374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  51.39 
 
 
374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  48.23 
 
 
370 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
376 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  47.33 
 
 
373 aa  332  9e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  48.52 
 
 
384 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  44.69 
 
 
392 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
367 aa  327  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  45.53 
 
 
372 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  44.79 
 
 
362 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  47.18 
 
 
358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  45.79 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  46.98 
 
 
362 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  45.79 
 
 
380 aa  310  4e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  46.69 
 
 
386 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  43.09 
 
 
379 aa  309  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  46.89 
 
 
365 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  46.89 
 
 
365 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  46.05 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  46.28 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  43.01 
 
 
385 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
363 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  44.2 
 
 
364 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  43.24 
 
 
381 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
388 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  43.98 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  42.62 
 
 
365 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  43.85 
 
 
365 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  43.45 
 
 
363 aa  272  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 
369 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  42.05 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  39.72 
 
 
370 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
370 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  39.32 
 
 
370 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
370 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
370 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
370 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
370 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.03 
 
 
370 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.87 
 
 
374 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  38.18 
 
 
370 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  42.24 
 
 
365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 
373 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
386 aa  248  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 
366 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
369 aa  245  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  41.34 
 
 
373 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
366 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
368 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
372 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
352 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
366 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  39.84 
 
 
371 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
372 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
365 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
370 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
365 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  40.36 
 
 
362 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
377 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
377 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
389 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
366 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 
392 aa  229  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 
360 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  38.98 
 
 
356 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
359 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
351 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  35.66 
 
 
368 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>