More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3228 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
375 aa  757    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  53.09 
 
 
362 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  52.57 
 
 
392 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  53.01 
 
 
368 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  53.48 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
365 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
365 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
368 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  48.62 
 
 
365 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  48.75 
 
 
366 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  49.31 
 
 
365 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  48.9 
 
 
365 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
365 aa  342  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  49.31 
 
 
364 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  48.63 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  47.51 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  49.32 
 
 
371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  48.9 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  48.34 
 
 
369 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  48.09 
 
 
368 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  48.2 
 
 
373 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  49.17 
 
 
372 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
372 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  49.17 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
370 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  48.07 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 
371 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  48.58 
 
 
361 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  43.94 
 
 
361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  43.02 
 
 
368 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  43.94 
 
 
362 aa  279  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  43.94 
 
 
361 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  43.66 
 
 
361 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  42.62 
 
 
367 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  44.72 
 
 
371 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  40.98 
 
 
368 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  42.98 
 
 
360 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  43.56 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  45.3 
 
 
372 aa  252  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
364 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  42.39 
 
 
370 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.37 
 
 
364 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  39.61 
 
 
362 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  40.44 
 
 
369 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  42.37 
 
 
374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  41.55 
 
 
374 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  41.88 
 
 
374 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  43.45 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
371 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  39.01 
 
 
369 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  37.7 
 
 
386 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
374 aa  219  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  39.51 
 
 
365 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.37 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  38.83 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
392 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
370 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 
388 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  39 
 
 
370 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 
370 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
370 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
386 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
379 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
362 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  39.13 
 
 
381 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
369 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  37.2 
 
 
367 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
370 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
385 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  40.62 
 
 
376 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
365 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 
373 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37.12 
 
 
362 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
363 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  36.76 
 
 
373 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  40.38 
 
 
374 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
358 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  39.52 
 
 
365 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  35.81 
 
 
380 aa  200  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
373 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 
370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 
374 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  38.83 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  38.83 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 
370 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  38.4 
 
 
374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
384 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
380 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  37.74 
 
 
363 aa  195  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>