More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4408 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 370 aa  725    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  56.78 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  54.08 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  61.05 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  52.69 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  60.29 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  54.8 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  52.89 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  53.2 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  53.52 
 
 		 359 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  55.31 
 
 		 351 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  55.65 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  56.57 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  54.21 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  54.32 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  48.63 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  50.99 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  49.01 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  46.94 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  46.94 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  46.67 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  48.21 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  47.98 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  49.03 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  52.62 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  49.58 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  46.5 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  48.04 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  45.3 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  45.58 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  50.15 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  46.94 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  41.64 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  45.26 
 
 		 366 aa  263  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  44.35 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  40.22 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  44.2 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  43.25 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  42.08 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  42.93 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  44.14 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  43.09 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  40.95 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  43.67 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  42.82 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  43.6 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  41.6 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  44.14 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  37.95 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  37.15 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.59 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  41.35 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  37.15 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  36.52 
 
 		 370 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.64 
 
 		 374 aa  222  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  41.19 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  39.67 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  34.9 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  41.14 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  37.15 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 		 386 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  41.48 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 		 370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  46.18 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  41.37 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  41.29 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  41.46 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  41.1 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>