More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3193 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
355 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  67.05 
 
 
351 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  56.82 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 
357 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  53.39 
 
 
374 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 
349 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 
351 aa  361  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  42.18 
 
 
373 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  42.13 
 
 
356 aa  262  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
356 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  41.9 
 
 
359 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  41.9 
 
 
359 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  41.9 
 
 
359 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  41.9 
 
 
359 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 
356 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
356 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 
356 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
356 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  41.57 
 
 
356 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  41.57 
 
 
356 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
359 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  41.34 
 
 
356 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  42.15 
 
 
353 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  38.35 
 
 
447 aa  255  7e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
357 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  41.23 
 
 
382 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  40.6 
 
 
356 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  40.95 
 
 
382 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  40.67 
 
 
382 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  39.65 
 
 
410 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
362 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  38.93 
 
 
401 aa  247  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  40.28 
 
 
356 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  39.28 
 
 
357 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 
371 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  38.7 
 
 
359 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
351 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
364 aa  232  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
365 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
365 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
360 aa  217  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
356 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
346 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
363 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 
346 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
360 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
371 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
346 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
370 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 
369 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
358 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
364 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  35.12 
 
 
371 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
358 aa  195  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.79 
 
 
386 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
366 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 
357 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 
371 aa  193  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
371 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
352 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 
371 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  38.62 
 
 
360 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
357 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  32.86 
 
 
356 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  35.65 
 
 
356 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
349 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  35.11 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
370 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 
344 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
370 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.18 
 
 
364 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
355 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  33.86 
 
 
364 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
365 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
373 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.21 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
370 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.21 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  33.94 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
370 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  32.79 
 
 
383 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 
349 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>