More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1655 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
356 aa  732    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  54.67 
 
 
356 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  57.35 
 
 
346 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  54.67 
 
 
356 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  54.21 
 
 
357 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  54.11 
 
 
356 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  54.11 
 
 
356 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  54.39 
 
 
356 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  54.67 
 
 
356 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  54.67 
 
 
356 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  54.39 
 
 
356 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  57.35 
 
 
346 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  54.39 
 
 
356 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  55.62 
 
 
346 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  52.68 
 
 
382 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  55.33 
 
 
346 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  52.81 
 
 
357 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  53.67 
 
 
362 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  52.68 
 
 
382 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  52.68 
 
 
382 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
359 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
359 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
359 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
359 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  52.41 
 
 
353 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  52.54 
 
 
356 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 
359 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  51.69 
 
 
356 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  51.59 
 
 
360 aa  348  6e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  48.16 
 
 
359 aa  345  6e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 
371 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  48.15 
 
 
356 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 
406 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  45.11 
 
 
368 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 
396 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  46.78 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  45.94 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  46.57 
 
 
399 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  47.4 
 
 
373 aa  309  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  46.57 
 
 
399 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  46.57 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
386 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  46.54 
 
 
348 aa  306  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  48.03 
 
 
360 aa  305  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  46.44 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  48.09 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  45.03 
 
 
351 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  40.69 
 
 
354 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  47.22 
 
 
362 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  40.52 
 
 
364 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
351 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
349 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
374 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.31 
 
 
348 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
355 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
351 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 
357 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
402 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  33.94 
 
 
410 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.98 
 
 
373 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
344 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 
364 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.92 
 
 
358 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.01 
 
 
364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  32.94 
 
 
447 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.01 
 
 
364 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 
351 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.78 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.3 
 
 
358 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.46 
 
 
401 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  31.89 
 
 
369 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
356 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
357 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
355 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
363 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 
355 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
369 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
360 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  26.9 
 
 
368 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 
369 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 
358 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
365 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  28.84 
 
 
380 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
370 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 
352 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
373 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
366 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  29.56 
 
 
366 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
369 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  27.94 
 
 
360 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2316  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 
365 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>