More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1211 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  98.88 
 
 		 356 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  99.44 
 
 		 356 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  98.88 
 
 		 356 aa  725    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  89.01 
 
 		 359 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  98.88 
 
 		 356 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 356 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  98.6 
 
 		 356 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  88.73 
 
 		 359 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  98.6 
 
 		 356 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  89.01 
 
 		 359 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  86.97 
 
 		 353 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  98.88 
 
 		 356 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  98.88 
 
 		 356 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  89.01 
 
 		 359 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  89.01 
 
 		 359 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  77.14 
 
 		 362 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  74.06 
 
 		 382 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  73.78 
 
 		 382 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  73.78 
 
 		 382 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  74.5 
 
 		 357 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 357 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  72.86 
 
 		 356 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  70.29 
 
 		 356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  61.34 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  61.63 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  60.47 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  59.59 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  58.96 
 
 		 346 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  54.67 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  54.94 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  50.15 
 
 		 359 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  48.41 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 406 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  47.74 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 396 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  44.54 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  48.28 
 
 		 352 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  45.64 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  44.1 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  45.58 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  43.82 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  43.91 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  43.54 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  43.54 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  43.6 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  42.58 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  42.58 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  43.6 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  42.82 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  42.13 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  36.57 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  38.37 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.59 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  39.11 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  33.07 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.9 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.26 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.08 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  35.6 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 363 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  30.15 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.09 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  29.67 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  31.36 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.8 
 
 		 371 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  32.41 
 
 		 382 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  29.76 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  31.39 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>